গবেষনার আগ্রহ
আমি গারভান ইনস্টিটিউটের একজন জিনোমিক সিস্টেম বিশ্লেষক, যার ক্লিনিকাল প্যাথলজি টেস্টিং, অ্যালগরিদম এবং সফ্টওয়্যার বিকাশের পটভূমি রয়েছে। সেন্টার ফর পপুলেশন জিনোমিক্সের জিনোমিক টেকনোলজিস গ্রুপের মধ্যে গণনাগত উন্নয়নে অগ্রণী, আমি নতুন বায়োইনফরম্যাটিক টুলস, সেইসাথে ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং পরিকাঠামো ডিজাইন এবং সমর্থন করার জন্য আমার অনন্য দক্ষতা প্রয়োগ করি।
আমার গবেষণা ক্ষেত্র অন্তর্ভুক্ত:
-
ন্যানোপোর সংকেত বিশ্লেষণ
-
ক্লিনিকাল পরীক্ষা এবং পদ্ধতি উন্নয়ন
-
সংক্ষিপ্ত টেন্ডেম পুনরাবৃত্তি ব্যাধি
-
ভাইরাল জিনোমিক্স (HIV/SARS-Cov-2)
-
একক-কোষ সিকোয়েন্সিং
-
সরাসরি আরএনএ সিকোয়েন্সিং
-
জিনোম সমাবেশ
-
মিথিলেশন সনাক্তকরণ
-
মেশিন/ডিপ লার্নিং
প্রকাশনার হাইলাইটস
ফার্গুসন, জেএমএবং এমএ স্মিথ (2019)। "স্কুইগলকিট: ন্যানোপোর সিগন্যাল ডেটা ম্যানিপুলেট করার জন্য একটি টুলকিট।বায়োইনফরমেটিক্স 35(24): 5372-5373।
স্মিথ, এমএ, টি. এরসাভাস,জে এম ফার্গুসন, H. Liu, MC Lucas, O. Begik, L. Bojarski, K. Barton এবং EM Novoa (2020)। "ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং এবং ডিপ লার্নিং ব্যবহার করে নেটিভ আরএনএ-এর আণবিক বারকোডিং।জিনোম রেস 30(9): 1345-1353।
ফার্গুসন, জেএম, এইচ. গামারাচ্চি, টি. নগুয়েন, এ. গোলন, এস. টং, সি. অ্যাকুইলিনা-রিড, আর. বোয়েন-জেমস এবং আইডব্লিউ ডেভসন (2021)। "ইন্টারআর্কিক: SARS-CoV-2 এবং অন্যান্য ভাইরাসের পুরো-জিনোম ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণের জন্য একটি ইন্টারেক্টিভ ওয়েব অ্যাপ্লিকেশন।"বায়োইনফরমেটিক্স।